Την εντολή έδωσε ο προϊστάμενος της Εισαγγελίας Πρωτοδικών, Αντώνης Ελευθεριάνος, ο οποίος ζήτησε να διενεργηθεί εισαγγελική έρευνα για τις καταλήψεις στα πανεπιστήμια, κατά της θεσμοθέτησης των μη κρατικών ΑΕΙ, με αποτέλεσμα να υπάρχει κίνδυνος να χαθεί η εξεταστική περίοδος.
Η προκαταρκτική εξέταση στρέφεται προς όλες τις κατευθύνσεις για τη διερεύνηση διάπραξης τυχόν αυτεπαγγέλτως διωκομένων πράξεων όπως διατάραξη δημόσιας υπηρεσίας, παράνομη βία και παράβαση καθήκοντος.
Συγκεκριμένα, ο εισαγγελέας, Νικόλαος Μαργαρίτης, ο οποίος αναλαμβάνει τη διενέργεια της έρευνας, θα αναζητήσει ευθύνες τόσο εκείνων που συμμετείχαν στις καταλήψεις όσο και άλλων προσώπων. Γι΄ αυτό, θα διερευνηθεί και τι ενέργειες έγιναν εκ μέρους των αρμόδιων πρυτανικών αρχών για την αποτροπή των καταλήψεων καθώς και σε ποιες ενέργειες προχώρησαν μετά τις καταλήψεις στο πλαίσιο της άσκησης των καθηκόντων τους.
Λόγω του κατεπείγοντος χαρακτήρα άμεσα θα αρχίσουν οι καταθέσεις με τον εισαγγελέα να καλεί ως μάρτυρες και εκπροσώπους των πρυτανικών αρχών.